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| Materia | Horas bajo conducción académica | Horas trabajo independiente | Créditos |
| Estructura de la materia | 60 | 68 | 8 |
| Química-física avanzada | 60 | 68 | 8 |
| Laboratorio de investigación I | 32 | 160 | 12 |
| Laboratorio de investigación II | 32 | 160 | 12 |
| Laboratorio de investigación III | 32 | 160 | 12 |
| Laboratorio de investigación IV | 32 | 160 | 12 |
| Laboratorio de investigación V | 32 | 160 | 12 |
| Seminario de investigación I | 32 | 64 | 6 |
| Seminario de investigación II | 32 | 96 | 8 |
| Seminario de investigación III | 32 | 96 | 8 |
| Seminario de investigación IV | 32 | 96 | 8 |
| Seminario de investigación V | 32 | 96 | 8 |
| Seminario de investigación VI | 32 | 96 | 8 |
| Seminario de investigación VII | 32 | 288 | 20 |
| Seminario de investigación VIII | 32 | 288 | 20 |
| Optativa I | 60 | 68 | 8 |
| Optativa II | 60 | 68 | 8 |
| Optativa III | 60 | 68 | 8 |
| Optativa IV | 60 | 68 | 8 |
| Optativa V | 60 | 68 | 8 |
| Optativa VI | 60 | 68 | 8 |
| Álgebra lineal (Optativa) | 64 | 64 | 8 |
| Bioinformática (Optativa) | 60 | 68 | 8 |
| Biología molecular avanzada (Optativa) | 60 | 68 | 8 |
| Bioquímica avanzada (Optativa) | 60 | 68 | 8 |
| Biorreactores (Optativa) | 60 | 68 | 8 |
| Biotecnología de proteínas (Optativa) | 60 | 68 | 8 |
| Caracterización de materiales (Optativa) | 60 | 68 | 8 |
| Cinética y catálisis (Optativa) | 60 | 68 | 8 |
| Control inteligente (Optativa) | 64 | 64 | 8 |
| Control no lineal (Optativa) | 64 | 64 | 8 |
| Difracción de rayos-X (Optativa) | 60 | 68 | 8 |
| Dinámica de fluidos computacionales (Optativa) | 64 | 64 | 8 |
| Diseño de fármacos (Optativa) | 60 | 68 | 8 |
| Ecotoxicología (Optativa) | 60 | 68 | 8 |
| Electroquímica avanzada (Optativa) | 60 | 68 | 8 |
| Espectroscopia (Optativa) | 60 | 68 | 8 |
| Farmacología avanzada (Optativa) | 60 | 68 | 8 |
| Instrumentación virtual (Optativa) | 64 | 64 | 8 |
| Programación científica en FORTRAN (Optativa) | 60 | 68 | 8 |
| Proteómica (Optativa) | 60 | 68 | 8 |
| Química ambiental I (Optativa) | 60 | 68 | 8 |
| Química ambiental II (Optativa) | 60 | 68 | 8 |
| Química analítica avanzada (Optativa) | 60 | 68 | 8 |
| Química combinatoria (Optativa) | 60 | 68 | 8 |
| Química computacional (Optativa) | 60 | 68 | 8 |
| Química cuántica avanzada (Optativa) | 60 | 68 | 8 |
| Química de coordinación (Optativa) | 68 | 68 | 8 |
| Química de polímeros (Optativa) | 60 | 68 | 8 |
| Química orgánica avanzada (Optativa) | 60 | 68 | 8 |
| Química organometálica (Optativa) | 60 | 68 | 8 |
| Quimiometría (Optativa) | 60 | 68 | 8 |
| Simulación de procesos químicos (Optativa) | 60 | 68 | 8 |
| Síntesis orgánica (Optativa) | 60 | 68 | 8 |
| Sistemas lineales (Optativa) | 64 | 64 | 8 |
| Sistemas no lineales (Optativa) | 64 | 64 | 8 |
| Temas selectos I (Optativa) | 60 | 68 | 8 |
| Temas selectos II (Optativa) | 60 | 68 | 8 |